עוסק בעיקר במזבח העולה ובנושאים הקשורים למזבח כגון מקום בישול קדשי קדשים, קדשים קלים וכו. ובגבולות ארץ ישראל לעתיד ובעוד נושאים.
כנגד חמישה פרקים שבמסכת מידות על בית שני, חיבר הרמח"ל חמישה פרקים על בית שלישי, כפי שקיבל מהמלאך ש-מ-ו-ע-א-ל.